INTRONSERTER • BÊTA NAVIGATEUR

Conception de transgènes

Répartissez automatiquement des introns dans une séquence codante, ou choisissez leurs positions exactes. Le dernier intron peut utiliser une seconde séquence distincte.

● Calcul local — aucune séquence envoyée

1. Séquence de départ

Collez une séquence seule ou plusieurs entrées au format FASTA.

ADN codant
Insertion seule, séquence préservée Protéine
Rétrotraduction optimisée

Séquence FASTA ou brute

L’ADN doit contenir uniquement A, C, G et T, avec une longueur multiple de 3.

2. Placement des introns

Les introns sont insérés entre les deux nucléotides du motif choisi.

Mode de placement Motif d’insertion

Exon initial ≤ Exon cible ≈ Exon maximal ≤ Exon final ≤

Positions cibles en nucléotides, séparées par des virgules

Chaque cible sera ajustée au motif le plus proche dans un rayon égal à la longueur d’exon maximale.

Intron principal — rbcS2 intron 1 par défaut Utiliser un intron différent en dernière positionOption utile notamment pour un intron terminal spécifique ou rbcS2i2.

Séquence du dernier intron

3. Finitions facultatives

Ajouts ADN placés hors de la séquence utilisée pour déterminer les positions introniques.

Ajout 5′ Ajout 3′

Version bêta destinée au prototypage. Toute construction doit être contrôlée avant commande et validation expérimentale.

La construction apparaîtra iciRenseignez une séquence puis lancez la génération.

—

0introns insérés

ExonsIntron principalDernier intron distinct

—nt avant insertion

—nt au total

—longueurs des exons

Séquence FASTA générée

Adaptation navigateur de l’outil open source IntronSeRTer (licence BSD-3-Clause). Méthode : Jaeger, Baier & Lauersen, Algal Research 2019, doi:10.1016/j.algal.2019.101588.